זהות ויציבות של קו סלולרי

• פונקציית ליבה: על ידי זיהוי רצפים ספציפיים של שורת תאים-שחזור טנדם קצר (STR) והשוואתם עם מסדי נתונים סטנדרטיים בינלאומיים (כגון ATCC ו-DSMZ), ניתן לאשר את האותנטיות של זהות שורת התא;

• יתרונות זיהוי: הבחנה מדויקת של המקור של שורות תאים והימנעות מזיהום צולב-(כגון בלבול בין שורות תאים של בני אדם ועכבר) היא הערובה המרכזית לאמינות הנתונים ותאימות תעשייתית;

פונקציות ליבה: זיהוי מדויק של אתר ההחדרה, מספר ההעתקה ושלמות הרצף של גן המטרה בקווי תאים מהונדסים גנטית (כגון שורות תא ביטוי חלבון רקומביננטי וקווי תאים לעריכת גנים);

• איתור מוטציות גנים: סקר מקיף של חריגות גנטיות כגון מוטציות גנים (SNV), שינויים במספר העתקים (CNV), וריאציות מבניות (SV) בשורות תאים, וניתוח הקשר בין פנוטיפ קו התא ומאפיינים גנטיים;

• ניתוח שלמות כרומוזומלית: מזהה שינויים מבניים כגון מספר כרומוזומים לא תקין, טרנסלוקציה ומחיקה, ומעריך את היציבות הגנטית של שורות תאים;

• ניתוח גנים פונקציונלי: נתח את מאפייני הביטוי ומנגנוני הוויסות של גנים הקשורים לתפקודי הליבה של שורת תאים (כגון גנים של שגשוג, התמיינות ומטבוליזם) כדי לספק כיוון לאופטימיזציה של קו התא.